Духовное управление мусульман Карачаево-Черкесской Республики учреждено в 1990 году. С 1991 года муфтият возглавляет председатель – Исмаил хаджи Бердиев.

В состав ДУМ КЧР входит 110 зарегистрированных мусульманских организаций, 19 незарегистрированных групп, на территории республики действует около 130 мечетей. Идет строительство центральной мечети в Черкесске.

Учебное заведение – исламский институт им. Исмаила Бостанова. Вуз назван в честь основателя и первого ректора, заместителя председателя ДУМ КЧР, убитого неизвестными в 2009 году.

В январе 2010 года в республике широко отметили 20-летие ДУМ КЧР.